Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArxO35085 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArxO35085 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArxO35085 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArxO35085 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArxO35085 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArxO35085 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArxO35085 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArxO35085 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArxO35085 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArxO35085 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArxO35085 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms