Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra2O08842 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms