Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube3aO08759 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms