Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MttpO08601 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MttpO08601 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MttpO08601 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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