Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6401L7N2C0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6401L7N2C0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms