Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r88L7N1W8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Vmn2r88L7N1W8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Vmn2r88L7N1W8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Vmn2r88L7N1W8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r88L7N1W8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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