Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vmn2r78K7N6U5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn2r78K7N6U5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms