Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20795J3QP49 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms