Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21900J3QP38 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm21900J3QP38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21900J3QP38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21900J3QP38 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21900J3QP38 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21900J3QP38 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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