Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm17577J3QNF7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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