Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms