Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms