Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna9G3X8Z7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms