Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim55G3X8Y1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim55G3X8Y1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms