Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r167G3UW71 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms