Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms