Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms