Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms