Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8005F6YKY3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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