Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17555F6U8B9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms