Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20671F6TVX7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20671F6TVX7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms