Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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BC067074F6RXI4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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BC067074F6RXI4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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BC067074F6RXI4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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BC067074F6RXI4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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BC067074F6RXI4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BC067074F6RXI4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BC067074F6RXI4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BC067074F6RXI4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BC067074F6RXI4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC067074F6RXI4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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