Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

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Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pdzd7E9Q9W7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pdzd7E9Q9W7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pdzd7E9Q9W7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd7E9Q9W7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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