Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9G1

1700080E11Rik, RIKEN cDNA 1700080E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080E11RikE9Q9G1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700080E11RikE9Q9G1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700080E11RikE9Q9G1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms