Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5407E9Q7Q1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm5407E9Q7Q1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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