Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BC005561E9Q5E2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms