Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pgbd1E9Q492 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms