Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms