Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms