Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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