Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrp3E9Q1T6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrp3E9Q1T6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrp3E9Q1T6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrp3E9Q1T6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lrp3E9Q1T6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lrp3E9Q1T6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp3E9Q1T6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrp3E9Q1T6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms