Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt78E9Q0F0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms