Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdr1E9Q0B4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms