Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms