Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ddx60E9PZQ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms