Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5415E9PXF3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms