Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srp54bE9PXC0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms