Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MccE9PWI3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MccE9PWI3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms