Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms