Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms