Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam46aD3Z5S8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam46aD3Z5S8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms