Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms