Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd1D3YXK1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd1D3YXK1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms