Protein–RNA interactions for Protein: D3YX43

Vsig10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10D3YX43 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig10D3YX43 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig10D3YX43 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms