Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lce6aD3YV94 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lce6aD3YV94 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms