Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cttnbp2B9EJA2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms