Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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