Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia1B2RXQ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms