Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms