Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms